Diğer fiziksel su arıtma cihazları gibi, EMS de sudaki iyonlara, özellikle Ca++ ve HCO3-‘ye elektrik kuvveti uygular, onları zıt yönlerde hareket ettirir ve bir kısmını suda asılı duran nötr kristallere dönüştürür. “Tohum” dediğimiz bu kristaller, serbest iyonları emerek yüzeylere yapışarak zararlı kireç birikintileri oluşturmalarını engeller.

EMS’yi aile içinde benzersiz kılan ana fikir, elektrik kuvvetini nasıl ürettiği ve uyguladığıdır: EMS bir transformatör gibi davranır. Transformatörün çekirdeği olarak bir elektromanyetik çubuklar zinciri kullanır, birincil sargı EMS içindeyken, içindeki boru ve su ikincil sargının rolünü oynar. Bu, elektrik kuvvetinin boru boyunca uygulanmasına neden olur, bu da su döngüsünün her yerinde “tohumların” üretildiği anlamına gelir. Bunun bir başka yararı da EMS kurulumunun kolaylığı olacaktır: kesme, kaynak veya başka herhangi bir müdahale gerektirmez.